ZAAJ

Suivis long-terme 4P dans la ZAAJ : base d'un comparatif international

Patrick Giraudoux — 2024-08-29T11:46:49Z

Dans de nombreux écosystèmes, les rongeurs constituent la biomasse accessible la plus importante pour les petits et méso-carnivores. Les variations d'abondance des rongeurs déterminent le fonctionnement du sous-système "rongeurs - prédateurs - organismes et substances pathogènes - agrosystème" auquel ils appartiennent. Les rongeurs peuvent donc avoir un impact significatif sur les systèmes agricoles et la santé publique dans le monde entier.

Le contrôle de certaines populations s'impose dans certaines situations agronomiques, telles que celles rencontrées dans le Massif Jurassien (voir à ce sujet le dispositif 4P de la ZAAJ). Il est donc essentiel de mettre en place des stratégies de contrôle efficaces tout en minimisant l'impact sur l'environnement.

L'article Multi-stakeholder working groups to improve rodent management outcomes in agricultural systems paru dans l'International Journal of Pest Management présente et compare trois études de cas (1) le National Mouse Group d'Australie pour gérer les impacts des souris, (2) le Working Group Common Vole Management en Allemagne pour gérer les impacts du campagnol des champs, et (3) le dispositif FREDON implémenté dans la ZAAJ pour la gestion des campagnols terrestres, dont les concepts et outils ont été élaborés avec les chercheurs de Chrono-environnement.

Chaque groupe de travail national a évolué de manière indépendante, mais tous ont des structures remarquablement similaires, comprenant la surveillance, la modélisation/prévision, des réunions régulières avec les parties prenantes (y compris les producteurs, les chercheurs, le personnel des agences gouvernementales et autres), l'élaboration de conseils pour la gestion et l'identification des priorités en matière de recherche.

L'article révèle que le succès de ces groupes de travail est lié à (1) un large engagement des parties prenantes (en particulier les agriculteurs/producteurs), (2) un financement dédié à la recherche pour informer les stratégies de contrôle, (3) une dynamique maintenue à travers toutes les phases des cycles de population des rongeurs, et (4) un bénéfice pour toutes les parties prenantes.

L'usage de rodenticides, comme celui des autres phytosanitaires, devant être de plus en plus limité, ciblé, et si possible évité et la prise en compte de la complexité du vivant étant essentielle dans tels systèmes, de tels groupes de travail multi-acteurs deviendront de plus en plus nécessaires à l'avenir.

Accès à l'article : https://doi.org/10.1080/09670874.2024.2363877

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Quarante années de suivis des oiseaux nicheurs du bassin du Drugeon

Patrick Giraudoux — 2023-05-13T12:28:07Z

Un travail d'observation colossal

Cette étude est publiée dans Alauda, la revue française et internationale d'ornithologie de la SEOF. Réalisée dans le périmètre de la Zone atelier Arc jurassien, elle doit tout à la persévérance d'un naturaliste local, professeur des écoles, Dominique Michelat. Il a assuré bénévolement l'essentiel des observations protocolées pendant la durée de l'étude, et a été la cheville ouvrière de la continuité des observations. Il a mis sur le chantier une première analyse avec des permanents de la LPO Bourgogne Franche-Comté, et a été appuyé ensuite par un chercheur de l'UMR Chrono-environnement pour les analyses définitives et la rédaction. Cette étude a également bénéficié, à plusieurs reprises, du soutien financier de la DREAL de Bourgogne Franche-Comté, jusqu'à rendre possible la publication de ce numéro spécial d'Alauda.

Des communautés fragiles car dépendantes de l'intégrité et de la solidarité de leurs membres

Ces configurations impliquant des réseaux régionaux d'acteurs du monde naturaliste, de la recherche et de l'administration, et plus généralement, quand c'est possible, l'ensemble des acteurs régionaux et locaux intéressés aux résultats, sont exemplaires et précieuses, et typique de l'esprit d'une Zone atelier. Ce sont des communautés fragiles car dépendant d'un immense investissement bénévole, plutôt que de structures propices inexistantes ou dotées de moyens insuffisants. Elles fournissent des exemples de science citoyenne contribuant fondamentalement à la connaissance des socio-écosystèmes, appelant à une meilleure sauvegarde de la biodiversité régionale.

Une protection assurée par de nombreux classements...

Le bassin du Drugeon est une zone humide de 6520 hectares, située dans la plaine de Pontarlier - Frasne. Elle est reconnue à de très nombreux titres pour sa biodiversité. Elle inclut des sites classés en Espaces Naturels Sensibles, des ZNIEFF de type I et II et un arrêté préfectoral de protection de biotope. Elle est également reconnue comme une zone d'importance communautaire pour les oiseaux (ZICO), c'est un site Natura 2000, une zone de protection spéciale (ZPS) au titre de la directive « oiseaux », une zone spéciale de conservation (ZSC) au titre de la directive « habitats » et elle est classée au patrimoine mondial des zones humides (RAMSAR). Les tourbières de Frasne et de Bouverans, qui en font partie, sont classées en réserve naturelle régionale.

... pour autant encore insuffisants !

Soixante-trois (43 %) des 148 espèces nicheuses certaines ou probables figurent sur au moins une liste rouge aux échelles de l'Europe, de l'Europe des vingt-sept, de la France ou de la Franche-Comté et 19 espèces supplémentaires (13 %) sont en liste orange. Malheureusement, la plupart de ces espèces sont en déclin à l'échelle locale. 31 (38 %) de ces 82 espèces ont des populations nicheuses en diminution ou ont déjà disparu, 6 (7,3 %) sont des espèces nouvellement nicheuses mais présentent des effectifs très faibles, ce qui les rend très vulnérables

Pour en savoir plus...

Michelat, D., Dupuis, O., Vaniscotte, A., Giraudoux, P., 2023. Quarante ans d'évolution du peuplement d'oiseaux nicheurs dans le bassin du Drugeon, Franche-Comté, France. Alauda 91, 1–80. (pdf téléchargeable).

Dominique Michelat, Patrick Giraudoux (2023) : Suivi par IPA des populations d'oiseaux nicheurs dans le bassin du Drugeon, Franche-Comté, France (1998-2020). Chrono-environnement. doi:10.25666/DATAUBFC-2023-01-24

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International à la ZAAJ : retour sur les pullulations de campagnol terrestre en Galice

Patrick Giraudoux — 2023-03-16T17:40:54Z

Les monts cantabriques sont confrontés à des problèmes de pullulation de campagnols terrestres depuis une dizaine d'année, ce que des chercheurs de la ZAAJ et de la FREDON avaient pu constater en novembre 2021, à l'occasion d'un atelier où les expériences galiciennes et francomtoises avaient pu être partagées (voir compte-rendu ici).

Du 15 au 16 mars 2023, Aïtor Somoano Garcia et Ana del Cerro Arrieta, chercheur et chercheuse au Center for Animal Biotechnology (SERIDA) de Girón (Asturie) ainsi que Victor Arias, des services phytosanitaires et environnementaux de la Xunta de Galicia, ont effectué un séjour d'étude et d'échange dans la Zone atelier Arc jurassien.

Ils ont été accueillis chaleureusement le 15 au matin à la fruitière d'Indevillers par Cyrille Arguedas, Président de la coopérative puis des échanges ont eu lieu toute la journée autour de la gestion des prairies confrontés à des pullulations régulières de campagnol terrestre avec les administrateurs de FREDON 25/90 à savoir Baptiste Boiteux, son Président, Dominique Mougin et André Delavelle du canton de Maîche, Denis Pilloud, exploitant à Saint-Gorgon-Main et Charles Schelle administrateur FREDON BFC. Cette première journée, riche d'enseignement a permis d'appréhender l'approche collective de gestion des rongeurs, l'importance du réseau de surveillance biologique du territoire et des travaux partagés entre chercheurs et éleveurs.

La deuxième journée, avec la participation de Michael Coeurdassier, a été consacrée à la présentation de la ZERRAC et au programme DURBAN, visant à suivre et expérimenter le contrôle des populations de campagnols des champs en agriculture de conservation.

La matinée de la troisième journée, en salle, a permis le point des actions en cours en Galice et des perspectives de coopération.

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Le futur à déjà commencé 2022 !

Patrick Giraudoux — 2022-12-23T08:41:56Z

En 1972, le Club de Rome publiait le rapport « The limits to growth » qui allait pour la première fois mettre en évidence les dangers pour l'humanité d'une croissance économique et démographique sans fin. Cinquante ans après, le 22 novembre 2022, un colloque a réuni plus de 150 chercheurs, étudiants, élus et citoyens à la Saline Royale d'Arc-et-Senans pour échanger autour des enjeux environnementaux et comprendre la nécessité d'une transition écologique.

Huit regards sur la situation du monde tel qu'il est, huit points de vue sans concessions, mais aussi porteurs d'espoir.

Cette journée fut aussi l'occasion de célébrer le cinquantième anniversaire de la création par Serge Antoine du Centre International de réflexion sur le futur et le cinquantième anniversaire de la déclaration d'Arc-et-Senans rédigée par un collectif de chercheurs dont est issue l'intitulé de cette journée : « le futur a déjà commencé ».

Daniel Gilbert et Patrick Giraudoux, chercheurs de la Zone Atelier Arc Jurassien, et les six conférenciers vous proposent une synthèse de cette journée sous la forme d'une courte vidéo (5'57), un « nouvel appel d'Arc et Senans » à destination de tous. « Le futur a déjà commencé » et c'est à chacun de nous de le construire.

Dominique Bourg, professeur honoraire en Philosophie, Ecole polytechnique Lausanne.
Cédric Gaucherel, Directeur de recherche à l'INRAe en écologie théorique, Montpellier.
Daniel Gilbert, Professeur en écologie, université de Franche-Comté
Patrick Giraudoux, Professeur émérite en écologie, université de Franche-Comté
Natacha Gondran, Professeur en évaluation environnementale, Mines Saint-Etienne.
Olivier Hamant, Directeur de recherche à l'INRAe en Biologie, Ecole Normale Supérieure de Lyon
Michel Magny, Directeur de recherche au CNRS en Paléoclimatologie, université de Franche-Comté
Valentine Python, Conseillère nationale suisse, Docteur de l'École polytechnique fédérale de Lausanne en climatologie et sciences de l'environnement.

International : pullulations de campagnols terrestres en Galice

Patrick Giraudoux — 2021-11-09T07:44:00Z

Les monts cantabriques sont confrontés à des problèmes de pullulation de campagnols terrestres depuis une dizaine d'année. Aïtor Somoano Garcia, chercheur au Center for Animal Biotechnology (SERIDA) de Girón (Asturie), Victor Arias et Pablo Iglesias, des services phytosanitaires et environnementaux de la Xunta de Galicia, et Joan Alibés, éleveur et président de la Sociedad Gallega de Pastos y Forrajes, ont organisé une rencontre entre les éleveurs de la région, les techniciens agricoles, les associations et des élus, les 6-7 novembre à Triacastela (province de Lugo). Geoffroy Couval et Patrick Giraudoux y étaient invités à partager leur expérience sur le contrôle multifactoriel des populations de campagnols terrestres, acquise dans la Zone Atelier Arc jurassien, et la recherche-action dans ce socio-écosystème.

En Galice, de hautes densités de campagnols terrestres sont observées sur plusieurs milliers d'hectares dans des pâturages permanents d'altitude entre 900 et 1400 m, dans un paysage de mosaïque forestière, avec de vastes étendues sommitales de plusieurs centaines d'hectares de prairie permanente. Les exploitations agricoles sont généralement de petite taille (quelques dizaines d'hectares morcelés en petites parcelles), avec des troupeaux n'excédant guère une vingtaine de vaches (principalement rubia gallega), parfois moins, dans un contexte d'exode rural important où les exploitations peinent à être reprises.

Sur la base des exposés, des visites de terrain et des échanges, il ressort que :

Le contexte social et économique, et la mobilisation des éleveurs, sont considérés comme déterminants dans le succès du contrôle ;
La cartographie générale des zones subissant des pullulations et la description de leurs dynamiques spatio-temporelles interannuelles sont un préalable à la mise en place d'actions raisonnées. L'importance du long-terme est soulignée ;
L'identification d'un ou quelques groupes d'éleveurs mobilisés collectivement est essentielle pour mettre en place une ou quelques zones pilotes (quelques centaines d'hectares) où une formation des intéressés et les priorités d'action pourront être hiérarchisées. L'importance du collectif est essentielle ;
Les échanges scientifiques et techniques seront poursuivis entre les participants galiciens et asturiens aux journées et FREDON de Bourgogne Franche-Comté/CE/ZAAJ, afin d'aider à la mise en place de dispositifs intégrés permettant d'améliorer la situation actuelle.

Contacts :
Geoffroy Couval, FREDON de Bourgogne Franche-Comté
Patrick Giraudoux, Chrono-environnement

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Rongeurs - prédateurs

Presse

Campo Galego (en espagnol)
- Traduction en français

El Progresso


Extrait de El Progresso du 7 novembre 2021

1ère journée technique de la tourbière de Frasne

daniel.gilbert@univ-fcomte.fr — 2021-01-19T20:33:21Z

Pour mettre en en commun les connaissances acquises sur le site de la tourbière de Frasne, une rencontre s'est tenue en visio-conférence le 1er décembre 2020 entre scientifiques et gestionnaires pour faire le point sur le fonctionnement et la gestion du site.

Le Massif du Jura, de par son climat continental dégradé caractérisé par des précipitations abondantes et régulières tout au long de l'année, et par son contexte géologique hétérogène impliquant de nombreuses zones de résurgences et de stagnation de l'eau, est une région favorable à la présence de zones humides.

Depuis 2008, le laboratoire Chrono-environnement (Université de Bourgogne Franche-Comté) dans le cadre de la Zone Atelier de l'Arc Jurassien (ZAAJ) et du SNO tourbières et en collaboration avec divers acteurs locaux et nationaux (OSU THETA, OSUC, Université de Rennes I, Ecole des Mines, etc…) effectue le suivi hydro-météorologique (variabilité des précipitations, de la température entre autre), biogéochimique (échanges de carbone avec l'atmosphère) et écologique (évolution de la végétation sous changement climatique) via la station de recherche installée au cœur de la tourbière dite « active ».


Ponton de recherche de la tourbière de Frasne. Crédit photo : Daniel Gilbert

Le site a en outre bénéficié du programme européen Life-Tourbière du Jura qui a permis le financement de sa restauration hydro-écologique en 2015 et 2016 par la neutralisation des effets des fossés de drainage datant du 19ème siècle.

La journée a permis de réunir les scientifiques du laboratoire Chrono-environnement (paléo-environnement, géologie, hydrologie, écologie), les gestionnaires de la Réserve Naturelle Régionale des tourbières de Frasne-Bouverans (EPAGE Haut-Doubs Haute-Loue, Communauté de communes Frasne-Drugeon, Région Bourgogne Franche-Comté), et les structures associées aux réflexions sur le fonctionnement et la gestion du site (Lin'eco, l'école des Mines de Saint-Etienne, le Pôle relais tourbières, le Conservatoire d'espaces naturels de Franche-Comté).

Ces échanges ont mis en évidence :

L'intérêt paléo-environnemental du site et le rôle d'archive de la tourbe accumulée depuis près de 8000 ans qui permet de documenter les évolutions floristiques reflétant les variabilités du climat et des activités humaines régionales ;

L'efficacité des mesures de restauration hydrologique qui ont permis de faire remonter le niveau moyen de la nappe d'eau et de freiner la colonisation de la tourbière active par des espèces vasculaires (pins à crochets) ;

La complexité des modes d'alimentation en eau de l'écosystème tributaires de recharge par les précipitations, par les zones matures (boisées) à proximité de la tourbière active, et le rôle possible des circulations souterraines régionales en provenance des anticlinaux du Laveron et du plateau de Levier, dont les proportions pourraient changer selon les scénarios climatiques régionaux ;

Les enjeux concernant le rôle de stockage et de restitution de l'eau en aval du système et son rôle potentiel de soutien d'étiage ;

La réactivité biogéochimique de l'écosystème aux variabilités hydrométéorologiques et des dynamiques complexes d'échanges de carbone qui suggèrent que le site stocke du carbone atmosphérique depuis le début du suivi en 2018


Une journée d'échanges à Frasne. Crédit photo : Guillaume Bertrand, Alexandre Lhosmot, Geneviève Magnon, 2015-2020

Ces fonctions écologiques et services socio-écosystémiques sont cependant susceptibles d'être perturbés par les changements climatiques actuellement en cours, en particulier l'augmentation sensible des températures enregistrées sur le site depuis 2008. Et cette tendance pourrait s'accentuer.

Si aujourd'hui la température moyenne est de l'ordre de 6 à 7°C, les modèles climatiques du GIEC et recalculés localement indiquent qu'elle pourrait être de l'ordre de 9.0 °C ± 0.4 °C pour la période 2040-2070. Le RCP4.5 conduirait à une stabilisation de ce nouvel état du climat pour 2070-2100. En revanche, le RCP8.5 devrait induire un réchauffement supplémentaire (10.6 ± 0.6 ° C), correspondant à une augmentation de +4 degrés par rapport à la période de référence (1980-2010).

Cette synthèse sous forme de présentations et de discussions a donc permis de tracer de nouvelles perspectives concernant les investigations à venir et la valorisation de ce type de socio-écosystème qui témoignent des liens étroits entre les enjeux des changements locaux (climat, cycle du carbone, stockage de l'eau, évolution des usages agro-forestiers) et globaux et de l'importance de la pluridisciplinarité pour les aborder.

Les présentations et les échanges sont disponibles ICI et le film sur les travaux de restauration hydrologique de la tourbière ICI


Logos des partenaires de la journée technique

Contacts :

laboratoire Chrono-environnement : Guillaume Bertrand et Alexandre Lhosmot
EPAGE : Geneviève Magnon

Structure génétique des populations de lynx boréal et étude du régime alimentaire

daniel.gilbert@univ-fcomte.fr — 2021-01-04T09:43:30Z

Le projet LYNX vise à mieux comprendre la recolonisation du territoire par les populations de lynx françaises et à mesurer leur degré de diversité génétique et de connectivité avec les autres populations européennes.Un second objectif est d'étudier le régime alimentaire de l'espèce en France afin de mieux connaître la diversité des proies consommées.

(crédits : www.antoine-rezer.com - Fb & Instagram : AntoineRezerPhotographie)

Aspects génétiques de la viabilité des populations de lynx en France

En France, les populations de lynx boréal sont très fragmentées et présentent des effectifs réduits estimés à environ 140 individus (~115 dans le massif jurassien, ~20 dans les Alpes et ~5 dans les Vosges).

Bien que la faible diversité génétique potentielle des populations françaises soit l'une des menaces identifiées pour les populations de Lynx, elle n'a pas été caractérisée précisément bien qu'elle soit probable car suggérée par plusieurs éléments :

Issues de la réintroduction de quelques individus dans le Jura et les Alpes suisses dans les années 1970, les populations françaises de lynx sont contraintes génétiquement par un effet dit « fondateur » (i.e., quelques individus à l'origine de l'ensemble des populations) ;
Associés à la faible connectivité des populations à l'échelle européenne, les faibles effectifs ont pour conséquence de limiter le brassage génétique donc le polymorphisme ;
L'étude menée sur les populations suisses de lynx au début des années 2000 a montré qu'elles présentaient les plus faibles niveaux d'hétérozygotie et parmi les plus faibles diversités alléliques des 11 populations européennes étudiées (Breitenmoser-Würsten et Obexer-Ruff 2003)

Enjeux liés à l'étude du régime alimentaire

Dans la majorité de leur espace de vie, en Russie, en Espagne ou en Amérique du Nord, les différentes espèces de lynx se nourrissent beaucoup de lièvres ou de lapins. La situation est différente en Europe centrale pour le Lynx boréal où il est généralement admis qu'il consomme avant tout des chevreuils et plus secondairement des chamois. Des études ont montré que ces deux espèces représentaient près de ses 90% des proies. Ces chiffres ont été obtenus en utilisant des méthodes de télémétrie permettant de suivre à distance les déplacements des lynx. Un collier au cou du lynx émettait des signaux VHF permettant de le localiser à distance. Il a ensuite été possible d'utiliser des systèmes GPS, beaucoup plus précis. En suivant les lynx, il était possible de trouver les restes de leurs proies. Cette méthode permet de détecter les proies les plus grosses, les autres étant ratées ou sous-estimées. Par cette méthode, renards et lièvres sont ainsi considérés comme occasionnels, et les petits rongeurs comme absents. D'autres études se sont basées sur l'analyse directe des crottes des lynx. Elles confirment la part importante des chevreuils et des chamois, mais elles nuancent très fortement leur part et mettent en évidence nombre d'autres proies alternatives. Dans le Jura, l'analyse des fèces a montré que les lièvres représentaient près de 20% des proies du lynx, et les petits rongeurs comme les campagnols près de 18%. Dans les Vosges, trois-quarts des crottes contenaient des restes de petits rongeurs. En Slovénie et Croatie, un résultat étonnant a été de découvrir que le Loir était une proie très fréquente des lynx, les jeunes, moins expérimentés, et les femelles étant susceptibles de plus consommer ces petites proies alternatives car faciles à capturer. L'utilisation de colliers GPS est très précise pour les suivis géographiques d'un même lynx mais a pour contrainte le nombre limité d'individus qu'il est possible de suivre. Les méthodes basées sur l'analyse des fèces sont alors utiles pour obtenir des informations complémentaires par exemple en identifiant les proies alternatives, en permettant la comparaison des régimes alimentaires dans différents secteurs de l'aire de répartition ou en mettant en évidence les éventuelles variations intra- et interannuelles.
Cette étude permettra de mieux caractériser le régime alimentaire notamment l'importance relative des différentes proies consommées.

Des méthodes non-invasives d'étude de la structure génétique via l'utilisation de fèces et du régime alimentaire

La caractérisation de la structure génétique des populations de lynx en France apporterait des informations clés pour la gestion et la conservation de cette espèce menacée en lien avec l'aménagement de l'espace (connectivité des populations) ou le renforcement des populations (définition de l'origine optimale d'individus réintroduits). Des développements méthodologiques récents en biologie moléculaire permettent d'utiliser les fèces de lynx, échantillons non-invasifs et récoltables sur le terrain, pour décrire la structure génétique des populations (Krojerová-Prokešová et al. 2018 ; Mengüllüoğlu et al. 2019) ou le régime alimentaire.

(crédits : www.antoine-rezer.com - Fb & Instagram : AntoineRezerPhotographie)

Le projet LYNX

Le premier objectif du projet LYNX est de décrire l'histoire évolutive de la recolonisation du territoire par les populations de lynx françaises par l'analyse de leur ADN mitochondrial et de mesurer leur degré de diversité génétique et de connectivité avec les autres populations européennes à partir de marqueurs microsatellites. La première étape du projet est l'optimisation d'une méthode d'analyse de la structure génétique des populations de lynx à partir d'échantillons non-invasifs, i.e., des fèces récoltées sur le terrain. Elle s'appuie sur les compétences scientifiques et techniques d'Eve Afonso-Douablin, Audrey Cardot-Laboissière, Anne-Claude Goydadin, Michael Coeurdassier et Michel Gauthier-Clerc et les instrumentations de biologie moléculaire disponibles dans la plateforme PEA²t du laboratoire Chrono-Environnement. Il s'agit de développer l'analyse de l'ADN mitochondrial et de 20 à 25 marqueurs microsatellites sélectionnés parmi ceux déjà retenus pour l'étude des autres populations européennes. Suite à cette phase d'optimisation, des fèces collectées en milieu naturel seront analysées à partir de 2021.
Le second objectif est de décrire le régime alimentaire du lynx à l'aide de méthodes moléculaires de metabarcoding qui consistent à amplifier l'ADN d'un gène commun à toutes les espèces proies dont les restes sont présents dans les fèces, puis à séquencer l'ADN amplifié par séquençage haut débit. Les informations obtenues pourront être complétées par des analyses de macrorestes identifiés à l'aide d'une loupe binoculaire et si besoin une analyse microscopique de coupe de poils.
L'échantillonnage des fèces sera assuré par un réseau déjà opérationnel de partenaires ayant une très bonne connaissance de terrain du lynx. Ce réseau de collecte est coordonné par la Société Française pour l'Étude et la Protection des Mammifères Société Française pour l'Étude et la Protection des Mammifères et s'appuie sur des organisations locales impliquées dans la conservation de la biodiversité. Le projet LYNX bénéficie actuellement du soutien financier de la Zone Atelier Arc Jurassien, de l'Université de Franche-Comté (APR Chysalide 2021), du Zoo de la Garenne et de la Fondation Nature & Découvertes.

Contact : Eve Afonso, Michaël Coeurdassier, Chrono-Environnement

Un jardin de la Zone Atelier Arc Jurassien à la Saline Royale d'Arc-et-Senans

daniel.gilbert@univ-fcomte.fr — 2020-11-25T10:35:31Z

La Zone Atelier Arc Jurassien est partenaire d'un projet Interreg Franco-suisse consacré à la culture scientifique. L'objectif est de faire partager au plus grand nombre la question des interactions Hommes-Nature à partir du concept de Socio-Ecosystèmes (SES)

Pour répondre aux enjeux de préservation et de valorisation des écosystèmes et du développement économique de l'Arc Jurassien, le projet « Living Lab Arc Jurassien » réunit des acteurs du tourisme, de l'environnement et de la recherche français et suisses, pour développer un dispositif innovant de sensibilisation et d'éducation à l'environnement et au développement durable des socio-écosystèmes de l'Arc Jurassien. Initié sous le concept du Living lab, le plan d'action consiste à impliquer citoyens, chercheurs ainsi que des acteurs culturels de l'Arc jurassien dans les processus d'expérimentation de mesures de gestion concertée dans les domaines de l'eau, des milieux naturels, des espèces et des paysages à l'échelle transfrontalière en valorisant les richesses naturelles de ce territoire.

Le projet réunit la Saline royale d'Arc-et-Senans (site classé au patrimoine mondial de l'UNESCO), Evologia (centre d'insertion professionnelle et parc) et l'Université de Franche-Comté, qui intervient par le Jardin Botanique de Besançon. L'un des objectifs consiste à concevoir et aménager un jardin pérenne de la Zone Atelier Arc Jurassien à la Saline royale d'Arc-et-Senans permettant de présenter les écosystèmes jurassiens et à créer un livret numérique compilant les connaissances existantes sur les socio-écosystèmes de l'Arc jurassien.

Le livret numérique permettra de décrire le fonctionnement des 4 types principaux de socio-écosystèmes jurassien : agrosystèmes prairiaux, forêts, lacs et zones humides, systèmes Karst-rivières. L'objectif est de synthétiser les connaissances sur ces milieux (espèces clefs, fonctionnement écologique, trajectoire historique et pratiques) et de décrire la boucle « services écosystémiques - gestion adaptative » à l'échelle des différents SES (comme décrit dans Bretagnolle et al, 2019).

Voir les livrets

Contact : Daniel Gilbert, Chrono-environnement

Un suivi de 20 ans des prédateurs dans la ZELAC…

Patrick Giraudoux — 2020-11-18T08:30:45Z

Quelle est la réponse numérique des prédateurs aux variations d'abondance des campagnols prairiaux dans les écosystèmes où ceux-ci présentent de grandes variations d'abondance ? Telle est la question à laquelle ont cherché à répondre, par un suivi de 20 ans, la FREDON de Bourgogne Franche-Comté et le Laboratoire Chrono-environnement de l'Université et du CNRS.

Les campagnols peuvent atteindre des densités élevées avec des fluctuations de population pluriannuelles de grande amplitude (voir https://zaaj.univ-fcomte.fr/spip.php?article29). Ils sont à la base de la nourriture des communautés de vertébrés carnivores dans le nord de l'Eurasie et en Amérique du Nord. Ce statut les place au cœur des conflits de gestion où les préoccupations de protection des cultures et de santé sont souvent mises en opposition avec les problèmes de conservation.

Publié dans Ecology and Evolution, un suivi de 20 ans des prédateurs et de leurs proies dans la Zone expérimentale de lutte anticampagnols (ZELAC) (près de La Vrine) décrit les effets de ces variations de proies sur les densités de prédateurs et leur prélèvement alimentaire théorique quotidien.

L'article :

https://doi.org/10.1002/ece3.7020


Vidéo de présentation des résultats

> Adaptation de l'article en français dans Bourgogne Franche-Comté Nature

Un graphe du suivi...

Effets de l'augmentation de la population de renards

Ces travaux basés sur des comptages routiers diurnes et nocturnes montrent comment la communauté de prédateurs s'est réorganisée avec l'augmentation de la population de renard roux, qui avait été décimée par intoxication secondaire à la fin des années 1990 à une époque où la bromadiolone, un rodenticide, était utilisée alors à haute dose pour contrôler les populations de campagnol terrestre (elle est interdite à cet usage depuis mai 2021). Cette augmentation de la population de renard est concomitante de la diminution de la population de lièvre, de chat forestier et de chat domestique. Elle n'a cependant pas conduit à une augmentation du nombre moyen de prédateurs présents dans la zone d'étude, suggérant des compensations parmi les espèces résidentes en raison de la prédation ou de la compétition intraguilde (entre les espèces de prédateurs). Dans cette étude, le manque de données concernant les mustélidés tels que la martre, l'hermine et la belette, qui ne peuvent pas être comptées par la technique employée, ne permet cependant pas de déterminer formellement si ces compensations observées dans ce sous-ensemble communautaire (les prédateurs comptables par comptage routier) s'étendent à l'ensemble de la communauté des prédateurs de campagnols (mais cf Baudrot et al. 2020).

La corneille noire, les oiseaux de proie et les chats domestiques

La corneille noire représente du quart à plus de soixante pour cent en densité des prédateurs observés. Les grandes variations du nombre de prédateurs pendant les pics de pullulation de campagnols sont clairement attribuables à l'augmentation temporaire des populations d'oiseaux de proie mobiles, notamment la buse et le milan royal. De plus, la densité des chats domestiques corrobore leur rôle possible dans la régulation des populations de rongeurs dans un cercle de 400-500 m autour des villages.

L'effet de ces variations

La prise alimentaire des prédateurs étudiés varie, au cours d'un cycle de rongeurs, d'un facteur un à sept, alors que les populations de campagnols prairiaux varient d'un facteur un à plusieurs centaines. Cette comparaison indique que cette communauté de prédateur peut contrôler les densités de campagnols quand elles sont basses, mais de façon de plus en plus marginale au delà d'un certain seuil (estimé à 70-100 campagnols/ha dans un milieu très productif comme l'est par exemple une prairie de fauche).

La vidéo ci-dessous (20') explique comment une simulation dynamique peut-être établie à partir de ces données, et le simulateur ici, permet de l'expérimenter par vous même.

Cette étude fournit une base de connaissance solide fondée sur des données de terrain pour raisonner la gestion de la faune. Elle doit permettre un dialogue factuel et constructif sur les objectifs et options de gestion entre toutes les parties prenantes des socio-écosystèmes concernés par les variations de populations de rongeurs de grande amplitude (agriculture, chasse, protection d'espèces vulnérables, santé). Elle montre enfin comment une collaboration sur le long terme entre un organisme de recherche et un organisme intéressé à la gestion de la faune, peut produire des connaissances uniques améliorant la connaissance du système pour éclairer la prise de décision.

Lire l'article en français

Suivi à long-terme de la réponse numérique des prédateurs aux grandes variations d'abondance de campagnols prairiaux dans le Val d'Usiers, Massif du Jura

Contacts :

Penser la pandémie

Patrick Giraudoux — 2020-05-05T11:31:51Z

Plusieurs structures de recherche en Bourgogne-Franche-Comté, dont la Zone atelier Arc jurassien, s'associent dans l'organisation d'un séminaire interdisciplinaire par visioconférence pour penser la pandémie actuelle. La captation vidéo de chaque séance sera ensuite disponible sur une chaîne dédiée.

Voir le programme complet

Rejoindre les captations sur Youtube

Rejoindre les captations sur Canal U

Ressources complémentaires...

Cahier de propositions de la conférence "Une seule santé : en pratique ?" du 17 mars 2021
pdf de la conférence "Une seule santé au milieu du gué..." du Master ECOM-ALGER de l'Université de Kinshasa, du 18-20 mai 2021.
FAQ sur les vaccins : questions-réponses disponibles sur le site web de la ville de Besançon.
Séance spéciale du 17 janvier, 17:00 à l'Académie des sciences
Livraison de "En direct" de janvier 2021 : virus en contexte
Fête de la science, 9 octobre 2020 : table ronde "Penser la pandémie" (captation youtube)
Bruno Latour : quel État peut imposer des « gestes barrières » aux catastrophes écologiques ?
Leçon de clôture d'Alain Fischer au Collège de France "Les deux faces de la réponse immunitaire lors du Covid-19"
Comment les biais cognitifs peuvent altérer notre jugement (par Olivier Sibony)
Des références bibliographiques de certains séminaires peuvent être trouvées ici (Groupe Zotero "Penser la pandémie"). Ces références sont publiques et exportables. Les liens aux publications sont activables quand la cible est elle-même publique. Le cas échéant l'accès au pdf, si disponible, est possible sur inscription préalable. De même le dépôt de références n'est possible que sur inscription. Inscription à demander à Arnaud Macé ou Patrick Giraudoux